El Comité Científico, cuyo presidente es José Baselga, está formado por un máximo de doce miembros, designados por el patronato entre los científicos más destacados en las actividades propias del VHIO. El cargo de presidente tendrá una duración de cuatro años, renovables por idénticos periodos de tiempo.

Las funciones del Comité Científico son la evaluación científica de la actividad de la Fundación y el asesoramiento a sus órganos. El director del VHIO, Josep Tabernero, actua como secretario del Comité Científico y participa en sus reuniones con voz pero sin voto.